„Dukati iz 2009. je bio najbolji i najlepši sa karbonskim elementima. Mnogi pričaju da sam ja jedini koji je uspeo da ukroti Dukati, ali nije baš tako, sve je to bio splet okolnosti“, rekao je Stoner

On je te sezone izgubio titulu pre svega zbog bolesti. Nije mogao da vozi na tri trke, a u Valensiji je imao nesreću u probnom krugu. Australijanac je, ipak, izbegao pitanja o eventualnom povratku takmičenju